Земля оказалась в полной власти пришельцев. Единственная надежда землян, организация XCOM, ликвидирована. Пришельцы обещая для всех беззаботное будущее, в глубине таят зловещие планы, уничтожая всех несогласных. Только окраины нового мира хранят в себе остатки свободы, сплотившись и собравшись с силами агенты организации готовы положить конец оккупации. Вас ожидают задания по всему миру, от диких земель до самого центра контролируемых пришельцами городов...